Vie du laboratoire
- Soumission d’un projet en réponse à la 6ème édition du Prix Unicancer de l'Innovation. Christophe Nioche a soumis le projet « LIFEx : un logiciel intégré pour une recherche en radiomique reproductible et transparente ». Il s’agira d’intégrer au logiciel gratuit LIFEx (www.lifexsoft.org) développé par Christophe un moyen simple de tester des modèles radiomiques publiés dans la littérature, avec comme 1er cas d’usage les modèles concernant le cancer du poumon.
Résultats scientifiques
- L’article de Fanny Orlhac et al concernant l’harmonisation de caractéristiques radiomiques en IRM a été accepté pour publication dans European Radiology. Cet article, intitulé "How can we combat multicenter variability in MR radiomics? Validation of a correction procedure » décrit et valide, sur des données fantômes et des données cliniques, une solution pour compenser la variabilité multicentrique affectant les caractéristiques radiomiques en IRM. Il complète les articles que nous avons publiés sur le sujet en TEP en 2018 (http://jnm.snmjournals.org/content/59/8/1321.full.pdf) et en TDM en 2019 (https://pubs.rsna.org/doi/pdf/10.1148/radiol.2019182023) et qui sont déjà largement cités. A noter aussi que l’article est accompagné d’une application gratuite et simple d’utilisation pour mettre en oeuvre la méthode proposée, adapté à toutes les modalités d'imagerie : https://forlhac.shinyapps.io/Shiny_ComBat/
- Deux présentations orales éclairs (lightning talks) de LITO seront données au congrès ESMRMB 2020 (https://www.esmrmb.org/congress/congress2020/), qui se tiendra virtuellement du 30 septembre au 3 octobre :
1) Marie-Judith Saint-Martin "Importance of applying ComBat besides image standardisation in multicentre Breast MRI radiomics: A phantom study"
2) Maxime Lacroix "Complementarity of T2-weighted and contrast-enhanced T1-weighted MR radiomic features for characterization of lung cancers »
Agenda
- Anne-Sophie Dirand a envoyé son manuscrit de thèse aux rapporteurs. Si ceux-ci l’autorisent à soutenir, sa soutenance de thèse se déroulera le 9 octobre à 9h sans l’amphithéâtre Nelly Riguet (Bâtiment 111) à Orsay.
- Prochaines réunions du groupe Radiomique (salle de réunion de LITO à Orsay + Teams) :
- Jeudi 3 septembre à 9 h : Présentation de Guillaume (résultats de son travail de stage de Master)
- Jeudi 10 septembre à 9 h : Présentation de Anne-Sophie (répétition en vue de sa soutenance de thèse de sciences)
- Mercredi 16 septembre à 9h : ouvert : sujet à déterminer - volontaires bienvenus !
- Mercredi 23 septembre à 9h : ouvert : sujet à déterminer - volontaires bienvenus !
- Jeudi 1 octobre à 9h : ouvert : sujet à déterminer - volontaires bienvenus !
Divers
- Les nouveaux codes labo pour l’accès à Inserm biblio viennent de m’être transmis. Vous pouvez donc accéder à Inserm Biblio (https://insermbiblio.inist.fr) soit avec vos identifiants personnels Inserm, soit avec le code labo :
identifiant : U1288-1
mdp : 8SWXXI
Merci de ne pas communiquer à des membres extérieurs au LITO
- Co-organisation d’une école d’été Radiomique et IA en médecine nucléaire : https://ifamp.eu/course1-online.html du 31 août au 2 septembre inclus. Cette école inclura des TP LIFEx, et en fonction de son succès et de la demande, nous pourrons envisager d'organiser une version française de l’école en 2021.
